Пустыни неандертальской ДНК указывают на быстрое очищение вредных архаичных вариантов

Материал подготовлен искусственным интеллектом на основе нескольких источников — ссылки на оригиналы приведены ниже.
Генетический анализ древних и современных геномов показывает, что неандертальская ДНК была быстро удалена из определённых участков человеческого генома в течение нескольких тысяч лет после скрещивания. Вывод основан на изучении 40-тысячелетней челюсти из Румынии и древних геномов из Германии и Чехии. Работа уточняет оценки времени и продолжительности скрещивания современных людей и неандертальцев.
Ключевые факты
- Мужчина, умерший в пещере Пештера-ку-Оасе в Румынии около 40 000 лет назад, нёс 6–9% неандертальской ДНК — самую высокую долю из когда-либо секвенированных.
- Его неандертальский предок жил всего за четыре–шесть поколений до него, судя по длинным неразорванным архаичным сегментам в хромосомах.
- Исследование, опубликованное в Science в декабре 2024 года, датировало средний момент смешения неандертальцев и современных людей примерно 47 000 лет назад, при этом поток генов продолжался около 7 000 лет.
- Сопутствующий анализ в Nature останков возрастом 45 000 лет из Раниса (Германия) и Златого коня (Чехия) связал архаичные участки с единственным событием смешения 45 000–49 000 лет назад.
- Леонардо Яси, один из авторов статьи в Nature, заявил, что неандертальские пустыни — области без архаичной ДНК — вероятно, сформировались очень быстро после потока генов.
Индивид из Оасе
Челюсть, найденная в Пештера-ку-Оасе в Румынии, принадлежала мужчине, умершему около 40 000 лет назад. Генетический анализ показал, что 6–9% его генома происходило от неандертальцев — самая высокая доля, когда-либо секвенированная у древнего или современного человека. Неандертальские сегменты ДНК в его хромосомах были всё ещё длинными и неразорванными, что указывает на неандертальского предка всего за четыре–шесть поколений до него. Исследователи, опубликовавшие работу в Nature, использовали этого индивида, чтобы показать, насколько ближе он был к событию смешения по сравнению с любым живущим сегодня человеком.
Время скрещивания
Черновой геном неандертальца из пещеры Виндия в Хорватии, собранный Ричардом Грином, Сванте Паабо и коллегами в 2010 году, впервые показал, что неандертальцы имеют больше общих генетических вариантов с жителями Евразии, чем с жителями Африки к югу от Сахары. То исследование оценило вклад неандертальцев в геномы неафриканцев в 1–4%, позже уточнённый до примерно 1–2%, причём у восточных азиатов его примерно на 20% больше, чем у европейцев. Две статьи, опубликованные в один день в декабре 2024 года, дали точную продолжительность перекрытия: исследование в Science под руководством Леонардо Яси и Манджуши Чинталапати сравнило 58 древних евразийских геномов с 275 современными и датировало среднее смешение примерно 47 000 лет назад, при этом поток генов продолжался 7 000 лет. Сопутствующий анализ в Nature останков возрастом 45 000 лет из Раниса (Германия) и Златого коня (Чехия) связал архаичные участки с единственным событием смешения 45 000–49 000 лет назад, общим для всех неафриканцев, секвенированных на сегодняшний день.
Неандертальские пустыни
Леонардо Яси, один из авторов статьи в Nature, сообщил изданию UC Berkeley, что неандертальские пустыни — длинные участки современного генома без архаичной ДНК — могли сформироваться очень быстро после потока генов. Древние человеческие геномы возрастом около 40 000 лет уже не показывают неандертальского происхождения в этих пустынях, что подтверждает вывод о быстром формировании. Эта картина указывает на то, что определённые неандертальские варианты были достаточно вредны в организме современного человека, чтобы быть устранёнными в течение нескольких тысяч лет.